28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1317 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1317  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  100 
 
 		 295 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00379803  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1161  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  36.65 
 
 		 170 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.95233  hitchhiker  0.00879473 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2348  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  31.21 
 
 		 242 aa  93.6  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.111592  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0567  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  33.92 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.00248457 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1514  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  27.49 
 
 		 282 aa  89.7  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0589166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2975  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  32.42 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1818  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.87 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1287  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30.21 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00222199 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0645  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  29.76 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0276  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  33.14 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1662  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.67 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  29.58 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1313  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  32.85 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2688  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  32.43 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1030  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  32.39 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0259  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  33.15 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0960  CRISPR-associated Cmr5 family protein  31.84 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0574  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  31.44 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1114  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.958745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3376  hypothetical protein  28.43 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1795  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  29.1 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0110  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  24.89 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.548091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1480  Cmr6 family CRISPR-associated RAMP protein  26.57 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_002950  PG1983  CRISPR-associated Cmr5 family protein  24.59 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.73204 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0631  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.94 
 
 		 403 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1947  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  25.18 
 
 		 473 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0662  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  27.41 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1198  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  28.38 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>