35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2975 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2975  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  100 
 
 		 391 aa  808    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0259  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  48.47 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0645  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  48.36 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1313  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  40.61 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1795  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  37.06 
 
 		 272 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1947  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  37.99 
 
 		 473 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  35.85 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1662  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30.36 
 
 		 271 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0320  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  30.1 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.44935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0662  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  33.68 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1818  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  31.37 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0574  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.27 
 
 		 331 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1198  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  29.52 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1030  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  29.7 
 
 		 242 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0631  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  31.5 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2688  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  27.97 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0695  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.21 
 
 		 313 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3376  hypothetical protein  28.52 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2293  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  32.8 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1582  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.12 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1480  Cmr6 family CRISPR-associated RAMP protein  30.85 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0960  CRISPR-associated Cmr5 family protein  32.77 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1287  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  31.06 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00222199 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0567  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  31.52 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.00248457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1317  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  32.42 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00379803  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1114  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  31.71 
 
 		 230 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.958745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1161  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  34.18 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.95233  hitchhiker  0.00879473 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2348  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  29.63 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.111592  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1514  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.4 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0589166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1983  CRISPR-associated Cmr5 family protein  28.48 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.73204 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0276  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  32.72 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0110  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28.29 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.548091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1354  hypothetical protein  25.71 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00474822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  29.03 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2591  hypothetical protein  25.73 
 
 		 331 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>