34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0645 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0645  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  100 
 
 		 341 aa  701    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0259  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  54.01 
 
 		 405 aa  272  7e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2975  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  48.36 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1313  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  47.6 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1795  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  41.91 
 
 		 272 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1947  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  32.62 
 
 		 473 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15110  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  33.08 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1662  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  30.92 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1818  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  34.54 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.162869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0631  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  35.98 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3376  hypothetical protein  31.9 
 
 		 328 aa  96.3  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1030  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  31.72 
 
 		 242 aa  95.9  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0574  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  28 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1198  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  32.32 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0662  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  33.16 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1480  Cmr6 family CRISPR-associated RAMP protein  30.14 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2688  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  32.02 
 
 		 369 aa  89.4  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0960  CRISPR-associated Cmr5 family protein  36.09 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1582  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  32.4 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0320  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  28.38 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.44935  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1161  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  36.42 
 
 		 170 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.95233  hitchhiker  0.00879473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1287  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  32.34 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00222199 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0567  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  36.25 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.00248457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0695  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.62 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1317  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  29.48 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00379803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2293  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  32.32 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1514  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  25.82 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0589166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0276  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  32.49 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2348  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  28.8 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.111592  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1114  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  33.33 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.958745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1983  CRISPR-associated Cmr5 family protein  29.01 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.73204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1354  hypothetical protein  25.33 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00474822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0110  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  25.58 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.548091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1820  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  33.96 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>