82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0710 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0710  von Willebrand factor type A domain protein  100 
 
 		 371 aa  760    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.283279 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1985  hypothetical protein  48.69 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2454  von Willebrand factor type A  28.66 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00561279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18980  von Willebrand factor type A-like protein  28.18 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136451  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35740  von Willebrand factor type A-like protein  26.87 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3961  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2370  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3079  von Willebrand factor type A  25.35 
 
 		 364 aa  89.4  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0708582  hitchhiker  0.000000341622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  23.96 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  27.57 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  24.57 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  25.53 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  23.78 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  23.21 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  24.03 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  27.03 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  25.19 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  23.77 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  23.84 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3386  von Willebrand factor, type A  24.32 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.384724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0567  von Willebrand factor, type A  24.32 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3556  von Willebrand factor, type A  27.03 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  24.24 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  22.92 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0172  von Willebrand factor type A domain protein  23.85 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.141772  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  26.58 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 		 611 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  25.67 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  22.13 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  21.99 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  25.17 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  21.74 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  22.81 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  27.2 
 
 		 316 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  23.17 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  25.87 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  21.9 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  21.86 
 
 		 320 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.4 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  23.15 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  24.18 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  21.25 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  21.62 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  21.9 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  22.87 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  22.86 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  22.93 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  21.03 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  24.19 
 
 		 595 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.49 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  18.59 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  23.33 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  23.68 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  21.92 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  23.49 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 		 754 aa  46.2  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  19.76 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  20.81 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  22.08 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  18.99 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  22.14 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  22.67 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  24.46 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  22.67 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  22.79 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  20.2 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  23.62 
 
 		 471 aa  44.3  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  20.99 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  22 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 533 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  21.13 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  23.26 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  22 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  25.81 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  19.23 
 
 		 327 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>