21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3079 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3079  von Willebrand factor type A  100 
 
 
364 aa  692    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0708582  hitchhiker  0.000000341622 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3961  von Willebrand factor type A  45.04 
 
 
399 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35740  von Willebrand factor type A-like protein  44.72 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496633  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2454  von Willebrand factor type A  35.8 
 
 
332 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561279 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18980  von Willebrand factor type A-like protein  38.48 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  37.89 
 
 
317 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2370  von Willebrand factor, type A  40.54 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1985  hypothetical protein  29.03 
 
 
343 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0710  von Willebrand factor type A domain protein  24.68 
 
 
371 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.283279 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  26.45 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0043  hypothetical protein  27.31 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  24.02 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  22.12 
 
 
344 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  21.05 
 
 
320 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  26.13 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  23.81 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  26.23 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  24.02 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0875  hypothetical protein  29.11 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134729  normal  0.367408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  29.07 
 
 
530 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  29.38 
 
 
585 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>