More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1125 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 130 aa  234  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  82.44 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  79.23 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  75.57 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  77.69 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  72.31 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  80.77 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  73.08 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  65.91 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  75.38 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  75.38 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  64.89 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  75.38 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  73.85 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  76.92 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  59.23 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  73.08 
 
 		 128 aa  123  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  64.66 
 
 		 132 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  69.23 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  74.24 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  71.54 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  61.19 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  68.46 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  62.31 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  75.38 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  67.18 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 		 127 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 129 aa  114  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  65.38 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  63.08 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  64.62 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  67.94 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  69.47 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  64.62 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  67.94 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  59.84 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  58.46 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  65.85 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  62.2 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  59.23 
 
 		 128 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  61.54 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  61.42 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  63.49 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  54.14 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  60.63 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  48.03 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  60.77 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  60.98 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  58.46 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  60 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  55.12 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 119 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  58.46 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  58.46 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  58.46 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  44.88 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 123 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>