More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  100 
 
 		 127 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  85.27 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  82.17 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  74.62 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  76.38 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  77.34 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  77.52 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  70.68 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  75.59 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  69.7 
 
 		 132 aa  153  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  77.69 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  74.05 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  80.47 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  87.4 
 
 		 127 aa  150  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  75.78 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  75.97 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  73.64 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  76.34 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  75.59 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  85.94 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  78.91 
 
 		 128 aa  143  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  76.15 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  67.18 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  75.59 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  70.23 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  66.15 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  72.44 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  67.19 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  72.09 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  65.38 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  73.08 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  68.03 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  67.44 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  67.44 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  67.44 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  66.92 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  66.92 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  65.04 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  60.48 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 127 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  65 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  62.7 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  59.68 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  64.84 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  62.18 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  62.1 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 		 125 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 		 125 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  62.18 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  75 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  55.83 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>