More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0579 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 128 aa  233  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  78.2 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  85.94 
 
 		 127 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  81.54 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  76.92 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  74.05 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  71.09 
 
 		 125 aa  144  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  82.03 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 		 129 aa  140  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  73.48 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  71.09 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  66.17 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  74.22 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  68.99 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  72.87 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  72.31 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  71.32 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  72.31 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  72.52 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  75 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  76.74 
 
 		 128 aa  130  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  68.18 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  70.99 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  74.81 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  65.91 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  71.88 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  68.46 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  65.65 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  67.19 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  65.04 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  67.18 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  65.71 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  63.08 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  63.08 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  63.08 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  67.92 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  60.8 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 129 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  60 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  60.63 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  59.17 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  61.98 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  60.83 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 		 124 aa  93.6  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  46.4 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  61.34 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  60 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  92  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  56.67 
 
 		 125 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  56.67 
 
 		 125 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>