More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0751 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 131 aa  243  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  76.34 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  77.86 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  73.28 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  70.23 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  70.99 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  80.15 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  69.47 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  70.23 
 
 		 129 aa  139  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  69.17 
 
 		 132 aa  138  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  82.44 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  73.28 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  78.63 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  78.63 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  78.63 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  70.23 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  68.18 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  72.52 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  69.4 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  72.52 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  76.52 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  71.76 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  75.57 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  61.83 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  70.99 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  65.65 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  79.39 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  74.81 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  72.52 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  77.36 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  68.7 
 
 		 129 aa  119  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  71.21 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  59.54 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  64.12 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  67.48 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  64.12 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  59.54 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  67.42 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  62.5 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  65.08 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  61.72 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 129 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  61.29 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  59.38 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  59.54 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  55.73 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  53.44 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 133 aa  98.2  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  45.31 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00226  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 123 aa  97.1  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  56.25 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  44.96 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  43.75 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  44.96 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 119 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002172  LSU ribosomal protein L7/L12 (L23e)  50 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1326  ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1473  50S ribosomal protein L7/L12  57.78 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0413  50S ribosomal protein L12P  47.66 
 
 		 124 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291542  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  55.17 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  55.17 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  59.54 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>