More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1371 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
125 aa  230  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  74.4 
 
 
125 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  71.2 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  73.6 
 
 
122 aa  137  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  74.4 
 
 
122 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  66.12 
 
 
126 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
128 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
121 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  68.03 
 
 
127 aa  124  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 
128 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  70.49 
 
 
126 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
119 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 
129 aa  120  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
121 aa  120  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
129 aa  120  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  63.49 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  66.12 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
127 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
125 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
126 aa  117  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
124 aa  116  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  66.12 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
120 aa  114  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  58.41 
 
 
123 aa  113  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  49.6 
 
 
121 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
128 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  69.81 
 
 
126 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  61.67 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  61.6 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1508  ribosomal protein L7/L12  66.14 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000145958  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
124 aa  111  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
123 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  63.2 
 
 
123 aa  111  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  67.5 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
125 aa  110  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
120 aa  110  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
124 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
123 aa  108  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
124 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
124 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
124 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
124 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
125 aa  108  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  47.2 
 
 
121 aa  108  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
126 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
124 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
124 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
129 aa  107  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
124 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  62.73 
 
 
131 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
121 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
121 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
121 aa  107  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  61.67 
 
 
124 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  56 
 
 
121 aa  107  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
121 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
121 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
121 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
121 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
121 aa  107  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
127 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
124 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1473  50S ribosomal protein L7/L12  65.08 
 
 
132 aa  106  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000879556  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
121 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  56.14 
 
 
124 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
122 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
126 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
123 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>