More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3690 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
120 aa  224  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  69.17 
 
 
119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  70.25 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  70.25 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  68.33 
 
 
120 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
125 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
126 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  67.21 
 
 
122 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
122 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
128 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
127 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
125 aa  117  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
124 aa  115  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  63.33 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  63.33 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  63.33 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  65.29 
 
 
124 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
125 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  65.04 
 
 
123 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  55 
 
 
121 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
124 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
124 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
129 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  55.83 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  66.39 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  49.17 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0568  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  64.41 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  62.81 
 
 
129 aa  110  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1301  50S ribosomal protein L7/L12  64.17 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0017753  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  60.83 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  63.41 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  61.48 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  62.18 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  58.2 
 
 
124 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  64.1 
 
 
124 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  64.41 
 
 
124 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0045  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 
124 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441674  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  65.55 
 
 
127 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4443  50S ribosomal protein L7/L12  68.64 
 
 
125 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  61.34 
 
 
126 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  57.63 
 
 
124 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  56.67 
 
 
122 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 
125 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  63.56 
 
 
124 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  61.54 
 
 
124 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
125 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  61.16 
 
 
125 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0587  50S ribosomal protein L7/L12  63.56 
 
 
125 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 
133 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
124 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 
123 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
125 aa  104  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 
123 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
127 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 
126 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3190  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
124 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 
128 aa  103  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 
125 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  62.71 
 
 
124 aa  103  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  58.12 
 
 
123 aa  103  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
128 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1508  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
127 aa  103  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000145958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 
127 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  62.07 
 
 
123 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 
125 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
129 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  58.87 
 
 
126 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
125 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0272  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
121 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.079724  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
128 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  51.67 
 
 
122 aa  102  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3641  50S ribosomal protein L7/L12  62.71 
 
 
125 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.180921 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0111  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 
119 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.6816200000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0100  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 
119 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000739106  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  60.83 
 
 
126 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
128 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0131  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 
119 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000232329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
127 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>