More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0299 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
128 aa  240  5e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  80.47 
 
 
127 aa  152  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  76 
 
 
125 aa  150  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  78.05 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  71.2 
 
 
125 aa  144  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  77.69 
 
 
124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  71.2 
 
 
123 aa  142  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  69.42 
 
 
126 aa  141  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 
128 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 
121 aa  140  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
125 aa  138  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  76.03 
 
 
124 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  71.88 
 
 
127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  71.2 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
129 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  70.4 
 
 
122 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  70.54 
 
 
129 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  70.31 
 
 
126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  69.53 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  70.31 
 
 
127 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  76.23 
 
 
126 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  68.6 
 
 
126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  70.25 
 
 
126 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  69.05 
 
 
128 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  69.6 
 
 
119 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  69.05 
 
 
128 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  68 
 
 
125 aa  130  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  72.27 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  67.19 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  67.19 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  61.02 
 
 
123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
127 aa  127  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  68.8 
 
 
123 aa  127  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
125 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  69.17 
 
 
124 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
128 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  69.53 
 
 
125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  65.83 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
126 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  69.05 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  71.2 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1508  ribosomal protein L7/L12  71.65 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000145958  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
125 aa  124  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 
125 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
125 aa  124  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  68.75 
 
 
125 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
128 aa  123  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
128 aa  123  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
124 aa  123  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
119 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  67.21 
 
 
123 aa  123  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
126 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
124 aa  122  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  62.2 
 
 
133 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
126 aa  122  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
127 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
121 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 
124 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  64.41 
 
 
126 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 
124 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  71.19 
 
 
127 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
124 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
124 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
124 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
124 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
124 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
124 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 
121 aa  121  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  70.4 
 
 
126 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
124 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  121  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
124 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
124 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
123 aa  120  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  70.94 
 
 
125 aa  119  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
124 aa  120  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
120 aa  120  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  68.33 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  68.33 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  65 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>