More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3817 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
124 aa  225  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
124 aa  225  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
124 aa  225  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
124 aa  225  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
124 aa  225  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
124 aa  225  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
124 aa  225  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  81.45 
 
 
124 aa  168  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0240  50S ribosomal protein L7/L12  96.77 
 
 
124 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0216202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3077  50S ribosomal protein L7/L12  97.58 
 
 
124 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0267  50S ribosomal protein L7/L12  94.35 
 
 
124 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0258  50S ribosomal protein L7/L12  94.35 
 
 
124 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0109491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0318  50S ribosomal protein L7/L12  93.55 
 
 
124 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00372625  normal  0.202232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2768  50S ribosomal protein L7/L12  93.55 
 
 
124 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.549753  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0339  50S ribosomal protein L7/L12  93.55 
 
 
124 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.784286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3438  50S ribosomal protein L7/L12  91.13 
 
 
124 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0316636  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3190  50S ribosomal protein L7/L12  79.03 
 
 
124 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3315  50S ribosomal protein L7/L12  79.84 
 
 
124 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801397  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2968  50S ribosomal protein L7/L12  79.84 
 
 
124 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  75.2 
 
 
125 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0045  50S ribosomal protein L7/L12  77.42 
 
 
124 aa  140  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  71.77 
 
 
124 aa  140  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  75 
 
 
124 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  72 
 
 
125 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  71.43 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  69.84 
 
 
126 aa  137  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  70.16 
 
 
124 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  69.05 
 
 
126 aa  135  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  68.55 
 
 
123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3653  50S ribosomal protein L7/L12  84.68 
 
 
124 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0108819  hitchhiker  0.000000546244 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  69.05 
 
 
128 aa  131  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0305  50S ribosomal protein L7/L12  84.68 
 
 
124 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246091  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  66.39 
 
 
122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  68.5 
 
 
127 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 
126 aa  130  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4443  50S ribosomal protein L7/L12  76.8 
 
 
125 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  130  9e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3035  50S ribosomal subunit protein L7/L12  76.61 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2849  50S ribosomal protein L7/L12  82.4 
 
 
125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3641  50S ribosomal protein L7/L12  72 
 
 
125 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.180921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 
122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  69.42 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  75 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  66.39 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  66.95 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
127 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  66.39 
 
 
123 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 
126 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0587  50S ribosomal protein L7/L12  72 
 
 
125 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
125 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
126 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
123 aa  124  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  64.71 
 
 
125 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
122 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 
126 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 
126 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
122 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  64.46 
 
 
126 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
125 aa  123  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
127 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
128 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
125 aa  121  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
128 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
129 aa  121  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
123 aa  120  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  61.16 
 
 
129 aa  120  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
126 aa  120  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  120  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  65.55 
 
 
123 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  67.23 
 
 
124 aa  120  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  65.55 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3452  50S ribosomal protein L7/L12  70.4 
 
 
125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  63.49 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  64.71 
 
 
123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  63.72 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 
133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
126 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
121 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1457  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
125 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000553031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
121 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
128 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
121 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
121 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
125 aa  118  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
121 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  65.04 
 
 
123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>