More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0206 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
124 aa  224  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  78.57 
 
 
126 aa  173  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  83.06 
 
 
124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  82.03 
 
 
128 aa  158  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  76.67 
 
 
123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  76.98 
 
 
126 aa  148  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  74.6 
 
 
126 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  77.6 
 
 
125 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  73.55 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  62.81 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  68.91 
 
 
124 aa  130  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  64.6 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 
127 aa  127  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  73.02 
 
 
125 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
129 aa  127  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  73.95 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  71.43 
 
 
122 aa  123  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
126 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 
121 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  61.34 
 
 
125 aa  122  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  68 
 
 
129 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  69.75 
 
 
123 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  69.6 
 
 
129 aa  120  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  62.18 
 
 
124 aa  120  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  61.16 
 
 
125 aa  120  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  69.17 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  73.17 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  69.17 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  67.77 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  68.07 
 
 
125 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  61.34 
 
 
125 aa  118  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  67.2 
 
 
125 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  60.31 
 
 
129 aa  118  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  68 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  63.87 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  64.86 
 
 
123 aa  117  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 
121 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  62.18 
 
 
121 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  62.18 
 
 
121 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1473  50S ribosomal protein L7/L12  59.85 
 
 
132 aa  117  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000879556  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  67.5 
 
 
127 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  67.23 
 
 
119 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 
125 aa  116  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  63.03 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 
127 aa  115  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 
123 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  66.12 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  63.93 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  63.03 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  62.71 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  61.34 
 
 
122 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
124 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 
124 aa  114  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
126 aa  114  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
123 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 
125 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  53.78 
 
 
122 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  61.67 
 
 
126 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  61.67 
 
 
126 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 
123 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  53.78 
 
 
122 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
124 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  61.95 
 
 
125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
124 aa  113  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  59.17 
 
 
126 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  62.18 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  61.34 
 
 
123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  63.39 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  65.55 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  66.39 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  61.98 
 
 
123 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  60.5 
 
 
125 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  58.56 
 
 
123 aa  111  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  65.83 
 
 
127 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  62.18 
 
 
124 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
128 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  63.03 
 
 
124 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  52.1 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>