More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0480 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
121 aa  224  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  78.05 
 
 
123 aa  159  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 
121 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 
121 aa  118  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
121 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0639  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.500427  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  64.46 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  65.83 
 
 
119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  60.5 
 
 
124 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  60.5 
 
 
124 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2675  ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000113086  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  60.16 
 
 
128 aa  110  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  60.83 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
126 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 
126 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1175  50S ribosomal protein L7/L12  56.52 
 
 
126 aa  107  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000154127  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  56.41 
 
 
123 aa  107  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
126 aa  105  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
124 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  58.06 
 
 
124 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0746  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
124 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00478946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  59.17 
 
 
125 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
124 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2543  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 
124 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
126 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 
128 aa  104  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
125 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
129 aa  104  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
124 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 
123 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
125 aa  104  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  57.63 
 
 
124 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 
121 aa  103  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 
125 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
122 aa  103  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  56.35 
 
 
126 aa  103  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
125 aa  103  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
121 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
121 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
121 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 
125 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
121 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
121 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
121 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
121 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
121 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
124 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  55.74 
 
 
121 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
122 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  62.39 
 
 
120 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
122 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 
129 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0150  ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
122 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000840717  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0162  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
122 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000100689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
126 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
121 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
121 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
120 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  63.33 
 
 
123 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
121 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
126 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  56.67 
 
 
125 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 
122 aa  101  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 
128 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
125 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
129 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
125 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
125 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
121 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
121 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
125 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  58.82 
 
 
123 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4064  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
121 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112087  hitchhiker  0.00864262 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
124 aa  100  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  51.16 
 
 
129 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0587  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 
125 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
127 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  52.46 
 
 
129 aa  100  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4481  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
121 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4394  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
121 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000226611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4558  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
121 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.347891  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4484  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
121 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4362  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
121 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.993642  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
125 aa  100  9e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3732  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 
122 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1301  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0017753  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>