More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1429 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
126 aa  229  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  65.12 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  65.89 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 
128 aa  120  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  69.17 
 
 
124 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 
121 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 
127 aa  118  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  67.21 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
124 aa  115  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
124 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
124 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
124 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
124 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  65.04 
 
 
122 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
124 aa  114  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
124 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
124 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
123 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  64.52 
 
 
123 aa  114  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
128 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  62.39 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  61.54 
 
 
129 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
126 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  62.88 
 
 
129 aa  110  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3315  50S ribosomal protein L7/L12  65.81 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801397  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  64.17 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2968  50S ribosomal protein L7/L12  65.81 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
125 aa  110  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
125 aa  110  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 
121 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 
124 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
124 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  62.4 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 
128 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
120 aa  107  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  53.45 
 
 
123 aa  107  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 
127 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
125 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3035  50S ribosomal subunit protein L7/L12  62.6 
 
 
124 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  60.16 
 
 
126 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
123 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
123 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 
128 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 
125 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  52.99 
 
 
124 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0568  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
122 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
125 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
125 aa  104  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 
127 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 
119 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
121 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 
127 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
121 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
121 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
122 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
121 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
126 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 
122 aa  103  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  60.16 
 
 
124 aa  104  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
123 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 
122 aa  103  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 
123 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 
129 aa  103  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3190  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
124 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0045  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
124 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
123 aa  102  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
122 aa  102  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  59.02 
 
 
129 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
125 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1863  50S ribosomal protein L7/L12  60.38 
 
 
126 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0765913  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 
128 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 
128 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>