More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1301 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1301  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
121 aa  220  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0017753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0568  50S ribosomal protein L7/L12  88.52 
 
 
122 aa  167  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166247  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  81.82 
 
 
121 aa  152  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1416  50S ribosomal protein L12P  66.94 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000264913  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0272  50S ribosomal protein L7/L12  69.42 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.079724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  69.83 
 
 
119 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  66.12 
 
 
120 aa  120  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0314  50S ribosomal protein L7/L12  68.6 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000853139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  63.33 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 
128 aa  107  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  64.17 
 
 
120 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 
128 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  64.66 
 
 
119 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
124 aa  103  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
125 aa  103  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 
121 aa  102  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
125 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  63.56 
 
 
122 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
123 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  63.33 
 
 
122 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 
125 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  63.33 
 
 
122 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
123 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
125 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  61.86 
 
 
123 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 
122 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  62.18 
 
 
122 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 
129 aa  99  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  57.26 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  58.06 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  62.07 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  62.28 
 
 
124 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  47.11 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0100  50S ribosomal protein L7/L12  69.83 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00223543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0100  50S ribosomal protein L7/L12  69.83 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000739106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0096  50S ribosomal protein L7/L12  69.83 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0094  50S ribosomal protein L7/L12  69.83 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000432934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0131  50S ribosomal protein L7/L12  69.83 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000232329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0121  50S ribosomal protein L7/L12  69.83 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0111  50S ribosomal protein L7/L12  69.83 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.6816200000000005e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0100  50S ribosomal protein L7/L12  69.83 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000262739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5205  50S ribosomal protein L7/L12  69.83 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333786  unclonable  6.32751e-26 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  56.35 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0011  50S ribosomal protein L7/L12  59.32 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.492576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 
121 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 
121 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 
121 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 
121 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
124 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
124 aa  93.6  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0413  50S ribosomal protein L12P  54.03 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  55 
 
 
124 aa  93.2  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  57.14 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  54.69 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
125 aa  92  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  52.89 
 
 
121 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  54.69 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 
125 aa  92  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  44.63 
 
 
121 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  48 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  51.22 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  48.62 
 
 
123 aa  91.3  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  55 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  58.47 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  58.47 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01080  ribosomal protein L7/L12  61.05 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  55.28 
 
 
123 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 
124 aa  89.4  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  44.96 
 
 
129 aa  89.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  43.9 
 
 
121 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  49.19 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>