More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1144 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 127 aa  224  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  67.19 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  63.49 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  62.5 
 
 		 129 aa  120  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  66.1 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  65.55 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  68.38 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  64.71 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  65.55 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  63.41 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  64.71 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  64.71 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  60.5 
 
 		 119 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  63.03 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  62.18 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  65.83 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  62.28 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  56.03 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  62.28 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  54.24 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  60.5 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  60.5 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  59.65 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0568  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  56.52 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  52.89 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  52.07 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  51.24 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  51.24 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  57.63 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  60.5 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  55.08 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  55.08 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  61.4 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  52.54 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  62.1 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1397  50S ribosomal protein L7/L12  55.93 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  56.3 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  52.89 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  59.48 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  60.83 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_002950  PG0393  50S ribosomal protein L7/L12  57.76 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  48.74 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  55.08 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00694  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 		 125 aa  94.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00030  50S ribosomal protein L7/L12  55.17 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  57.63 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4478  ribosomal protein L7/L12  52.1 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  57.63 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  53.78 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>