More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1397 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1397  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 127 aa  237  4e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  80.47 
 
 		 123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  70.87 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3450  50S ribosomal protein L7/L12  75 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0256667  normal  0.0368357 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0425  50S ribosomal protein L7/L12  75.59 
 
 		 127 aa  150  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00030  50S ribosomal protein L7/L12  75.59 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4478  ribosomal protein L7/L12  76.56 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0848  50S ribosomal protein L7/L12  71.65 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1942  50S ribosomal protein L7/L12  72.44 
 
 		 123 aa  140  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.542016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  67.72 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0393  50S ribosomal protein L7/L12  72.44 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0746  50S ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00478946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2543  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0233  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0819772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  58.26 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  73.61 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  52.67 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  54.39 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  48.82 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  53.78 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  52.94 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  55.73 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  51.26 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 127 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  51.97 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1421  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927716  normal  0.299454 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  50.43 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  52.46 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  69.01 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  48.82 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  53.54 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  49.58 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  47.06 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  71.43 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  64.86 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>