More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20970 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 129 aa  239  7.999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  76.74 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  77.52 
 
 		 128 aa  147  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  75.97 
 
 		 129 aa  146  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  76.74 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  75.19 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  70.99 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  68.99 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  73.08 
 
 		 130 aa  140  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  72.87 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  75.57 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  65.41 
 
 		 133 aa  136  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  76.74 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  73.85 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  76.74 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  74.42 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  72.31 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  71.32 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  73.08 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  74.62 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  67.44 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  67.18 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  65.38 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  73.08 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  70.77 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  68.85 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  75.38 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  63.57 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  65.12 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  61.9 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  63.08 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  62.02 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  62.02 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  69.52 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  61.9 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  62.02 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  61.98 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  61.11 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0271  50S ribosomal protein L12P  59.52 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0803416  hitchhiker  0.00134879 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  61.98 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  62.28 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>