More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23950 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  100 
 
 		 129 aa  234  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  76.74 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  71.32 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  72.87 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  70.23 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  68.22 
 
 		 125 aa  133  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  70.77 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  73.64 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  68.99 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  73.08 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  72.31 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  68.22 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  71.32 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  71.76 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  69.77 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  64.39 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  67.18 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  73.64 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  63.57 
 
 		 123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  71.54 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  67.44 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  75.19 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  66.92 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  63.16 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  68.46 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  64.12 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  74.42 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  68.46 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  70.77 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  69.23 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  63.49 
 
 		 128 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  67.69 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  67.69 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  67.69 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  73.33 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  62.31 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  62.02 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  47.62 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  61.11 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  47.62 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00226  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  62.79 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002172  LSU ribosomal protein L7/L12 (L23e)  52.38 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  57.14 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 		 128 aa  95.1  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  42.86 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  60.32 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  58.56 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  56.35 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>