More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6636 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 127 aa  233  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  79.39 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  74.05 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  73.64 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  70.45 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  74.42 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  74.42 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  74.42 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  74.62 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  67.44 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  66.15 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 		 127 aa  127  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  64.34 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  67.94 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  64.39 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  59.4 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  73.08 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  61.07 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  59.23 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  60.77 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  65.65 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  74.29 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  64.84 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  61.54 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  61.19 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  64.12 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  60.63 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  60.77 
 
 		 129 aa  110  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  67.29 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  61.6 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  49.19 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  48.39 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  57.26 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  58.02 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  56.45 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  48.39 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  52.94 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  52 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  44.35 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  44.35 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  48.39 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  56.3 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 127 aa  90.5  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  45.97 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  56.67 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>