More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4350 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 132 aa  248  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  80.45 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  75 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  76.52 
 
 		 129 aa  153  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  70.45 
 
 		 129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  73.48 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  71.21 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  67.42 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  71.21 
 
 		 129 aa  140  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  69.7 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  68.42 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  69.7 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  72.73 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  71.21 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  77.27 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  64.39 
 
 		 125 aa  135  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  69.7 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  72.18 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  72.93 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  72.18 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  67.42 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  75 
 
 		 130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  56.82 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  75.94 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  78.03 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  64.39 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  60.61 
 
 		 123 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  65.15 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  73.48 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  69.7 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  59.4 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  64.39 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  72.93 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  69.92 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  69.92 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  69.92 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  69.92 
 
 		 128 aa  116  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  53.79 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  66.17 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  66.92 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  56.59 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  55.81 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  59.09 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  48.84 
 
 		 129 aa  100  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  53.03 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  52.27 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  53.79 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  53.03 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  57.36 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00226  50S ribosomal protein L7/L12  48.06 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  51.16 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  53.54 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  48.84 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  53.79 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002172  LSU ribosomal protein L7/L12 (L23e)  49.61 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  53.79 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  43.41 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  43.41 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  43.41 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  53.79 
 
 		 127 aa  94  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  55.3 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  51.16 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  48.84 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  54.14 
 
 		 126 aa  93.6  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  57.58 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  42.64 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 		 126 aa  93.2  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  48.48 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>