More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_17260 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  100 
 
 
129 aa  236  9e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  80.62 
 
 
129 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  80 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  73.48 
 
 
132 aa  158  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  75.97 
 
 
127 aa  157  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  79.07 
 
 
129 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  75.94 
 
 
133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  75.97 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  73.64 
 
 
125 aa  150  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  76.34 
 
 
131 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  75.19 
 
 
129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  82.95 
 
 
128 aa  144  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  72.09 
 
 
123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  78.29 
 
 
128 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  74.42 
 
 
128 aa  141  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  75.38 
 
 
130 aa  140  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  81.4 
 
 
127 aa  140  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  69.77 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  74.81 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  75.38 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 
127 aa  138  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
128 aa  137  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  72.52 
 
 
131 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  73.08 
 
 
130 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  73.64 
 
 
129 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  76.15 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  76.92 
 
 
130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  67.18 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  71.32 
 
 
126 aa  131  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  77.69 
 
 
128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  67.44 
 
 
126 aa  130  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  65.38 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 
130 aa  127  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  75.41 
 
 
128 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  70 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
126 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  62.02 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 
125 aa  110  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  63.57 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  63.49 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 
128 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
128 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  69.23 
 
 
130 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  62.02 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
124 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  62.79 
 
 
127 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
128 aa  107  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  76.19 
 
 
130 aa  106  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 
129 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 
126 aa  106  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 
127 aa  105  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  68.42 
 
 
125 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
123 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  48.41 
 
 
121 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  55.56 
 
 
123 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 
126 aa  104  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  69.3 
 
 
123 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
125 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  69.3 
 
 
123 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
125 aa  105  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 
126 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
123 aa  103  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  68.42 
 
 
124 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 
126 aa  103  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 
127 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
125 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 
125 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 
122 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 
122 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  102  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  61.86 
 
 
127 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
123 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  71.05 
 
 
125 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
124 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
125 aa  101  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  64.91 
 
 
123 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
124 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
125 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 
129 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
126 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  61.9 
 
 
126 aa  100  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  62.81 
 
 
126 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
123 aa  99.4  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  53.03 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>