More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2701 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 125 aa  230  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  89.6 
 
 		 123 aa  172  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  70.54 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  68.46 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  71.09 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  75.59 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  68.99 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  65.41 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  67.19 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  65.12 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  66.93 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  68.7 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  73.44 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  65.12 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  66.15 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  66.15 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  66.15 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  68.22 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  70.08 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  64.89 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  63.78 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  68.25 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  68.25 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  71.09 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  63.85 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  66.92 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  61.83 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  67.69 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  65.38 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 129 aa  111  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  50.82 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  59.84 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 123 aa  107  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 		 125 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  58.12 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  61.9 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  66.92 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  53.04 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  57.26 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  47.54 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  56.91 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3917  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  63.85 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  52.03 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>