More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0916 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 127 aa  238  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  76.92 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  76.38 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  75.97 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  75 
 
 		 128 aa  147  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  73.08 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  67.94 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  70.54 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  68.42 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  68.18 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  65.65 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  71.88 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  67.69 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  72.87 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  70.23 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  74.02 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  69.77 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  73.85 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  70.87 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  72.52 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  66.14 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  68.99 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  69.77 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  67.72 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  75.78 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  72.31 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  71.54 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  73.08 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  72.44 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 		 128 aa  115  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  75.38 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  68.46 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  58.06 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  60.48 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  66.12 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  59.23 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  64.17 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  55.65 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  57.94 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>