More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2989 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  100 
 
 		 123 aa  223  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  89.6 
 
 		 125 aa  179  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  70.54 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  69.77 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  74.22 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  72.09 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  75.59 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  66.15 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  63.16 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  65.65 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  64.57 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  62.02 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  62.12 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  68.75 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  65.12 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  64.12 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  70.87 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  62.31 
 
 		 130 aa  130  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  63.57 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  64.62 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  62.31 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  68.25 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  65.87 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  71.09 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  62.31 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  66.15 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  63.57 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  63.57 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  63.57 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  58.78 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  63.08 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  69.23 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  53.33 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  57.26 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  63.33 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  47.5 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  51.67 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  47.5 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  58.2 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3917  50S ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  63.08 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  58.47 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  61.98 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  59.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  58.47 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  60.32 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 		 125 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  58.12 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 		 125 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  57.63 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  54.47 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  53.33 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  55.46 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  52.17 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  55.83 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>