More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1386 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 121 aa  222  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1301  50S ribosomal protein L7/L12  81.82 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0017753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0568  50S ribosomal protein L7/L12  73.77 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166247  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0272  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.079724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1416  50S ribosomal protein L12P  63.64 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000264913  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0314  50S ribosomal protein L7/L12  65.29 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000853139  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  58.73 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  63.79 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 123 aa  103  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  57.81 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  56.91 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  47.93 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  59.48 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  60.17 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  56.67 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  57.94 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  60.34 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  74.29 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  60.17 
 
 		 122 aa  95.9  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  53.33 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  45.45 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  55 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  52.03 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  52.03 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  42.98 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  48.46 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  49.12 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>