More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0542 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 133 aa  248  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  80.45 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  81.95 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  76.69 
 
 		 129 aa  146  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  72.18 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  70.68 
 
 		 129 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  73.68 
 
 		 127 aa  143  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  67.67 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  66.92 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  77.44 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  70.68 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  77.44 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  69.92 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  66.92 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  60.15 
 
 		 125 aa  130  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  67.67 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  70.15 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  67.91 
 
 		 131 aa  127  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  68.42 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  73.68 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  66.92 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  61.65 
 
 		 123 aa  125  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  66.17 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  77.44 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  69.4 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  66.92 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  70.68 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  69.4 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  66.17 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  66.17 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  54.89 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  61.65 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  55.97 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  70.9 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  57.89 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  66.42 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  66.42 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  66.42 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  55.64 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  70.37 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  58.46 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  52.24 
 
 		 129 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  65.67 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  56.15 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  56.92 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  56.92 
 
 		 126 aa  95.9  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  58.65 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  56.15 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  47.69 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  56.92 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  47.69 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  55.64 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  57.81 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  57.89 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  53.38 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  49.23 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  51.54 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  58.65 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  54.48 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  57.89 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  52.63 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  55.64 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  50.38 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  47.69 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  53.08 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  51.54 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  49.23 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  49.23 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  51.54 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>