More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2655 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2655  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 130 aa  245  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496978  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  82.31 
 
 		 129 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4350  ribosomal protein L7/L12  72.73 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  80.77 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  80 
 
 		 129 aa  157  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  74.62 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0542  50S ribosomal protein L7/L12  73.68 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.125779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2701  ribosomal protein L7/L12  68.46 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0719525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  75.38 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  72.52 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  76.15 
 
 		 129 aa  145  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  76.92 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  72.31 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  73.28 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4520  ribosomal protein L7/L12  77.86 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  68.46 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  73.08 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2989  50S ribosomal protein L12P / LSU ribosomal protein L12P  66.15 
 
 		 123 aa  135  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6058  50S ribosomal protein L7/L12  78.46 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  58.78 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  73.28 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0572  50S ribosomal protein L7/L12  80 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  70.77 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  70.77 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  72.95 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  71.76 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0679  ribosomal protein L7/L12  76.15 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0619  ribosomal protein L7/L12  72.31 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  66.15 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1073  RplL  75.57 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  70 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0579  ribosomal protein L7/L12  74.81 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.573662  normal  0.0129016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0995  50S ribosomal protein L7/L12  70.99 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0967  50S ribosomal protein L7/L12  70.99 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0985  50S ribosomal protein L7/L12  70.99 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350838  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  58.46 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10665  50S ribosomal protein L7/L12  68.7 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.67859e-19  normal  0.457138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  65.35 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  60.63 
 
 		 123 aa  105  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 		 129 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  63.48 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1019  ribosomal protein L7/L12  70.75 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  61.74 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  60.77 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  62.61 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  48.03 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  48.03 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  48.03 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  46.46 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  51.88 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  61.74 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  55.91 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1125  ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  56.15 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 124 aa  96.7  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>