More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0503 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
129 aa  241  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  75.4 
 
 
128 aa  154  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  75.4 
 
 
128 aa  154  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0356  50S ribosomal protein L7/L12  74.4 
 
 
128 aa  127  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 
128 aa  124  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 
125 aa  124  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
128 aa  122  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 
126 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1783  50S ribosomal protein L7/L12  74.02 
 
 
129 aa  120  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
125 aa  117  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
125 aa  116  7.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
126 aa  116  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
124 aa  115  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
123 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  63.57 
 
 
123 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  65.85 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  62.79 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  65.89 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  65.12 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
125 aa  111  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  111  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
127 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  65.85 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  62.02 
 
 
123 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  62.02 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  65.12 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
123 aa  110  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 
126 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
126 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 
129 aa  110  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 
125 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  63.08 
 
 
124 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
129 aa  110  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  64.34 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  62.99 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 
125 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
127 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
127 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 
126 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 
126 aa  106  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  62.79 
 
 
123 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 
125 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
123 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 
123 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
125 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
126 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
126 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  64.04 
 
 
131 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
124 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 
125 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 
125 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 
124 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 
126 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
126 aa  104  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2675  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
126 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000113086  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 
124 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  58.91 
 
 
129 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
123 aa  104  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  48.06 
 
 
124 aa  104  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
125 aa  104  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01080  ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
123 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  63.57 
 
 
123 aa  104  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
122 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
127 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
124 aa  103  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 
126 aa  103  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  60.8 
 
 
123 aa  103  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
124 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
122 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 
130 aa  103  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
122 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 
123 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
124 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
121 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
125 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  48 
 
 
121 aa  101  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
121 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
127 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
123 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
125 aa  101  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
125 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>