More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0693 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
127 aa  236  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  68.75 
 
 
128 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  74.8 
 
 
127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  75.59 
 
 
127 aa  144  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  71.65 
 
 
127 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  71.77 
 
 
125 aa  141  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  70.16 
 
 
125 aa  140  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  73.23 
 
 
127 aa  140  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  76.38 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  69.35 
 
 
125 aa  137  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  70.87 
 
 
127 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  68.55 
 
 
124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  67.46 
 
 
128 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  73.39 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
121 aa  130  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 
128 aa  130  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
124 aa  130  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  66.14 
 
 
127 aa  129  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  75.81 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  62.99 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
121 aa  127  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  65.35 
 
 
127 aa  126  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  68.55 
 
 
125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  69.35 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  70.08 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1457  50S ribosomal protein L7/L12  68.55 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000553031  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 
127 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
122 aa  123  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  61.98 
 
 
126 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
125 aa  122  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
123 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  66.12 
 
 
123 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0440  50S ribosomal protein L7/L12  72.8 
 
 
127 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
125 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  65.87 
 
 
128 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
122 aa  120  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
126 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
122 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
123 aa  120  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  67.48 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  67.74 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  66.14 
 
 
125 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  67.72 
 
 
125 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 
124 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  68.33 
 
 
124 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
126 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
126 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
124 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  66.14 
 
 
125 aa  117  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  65.35 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  67.72 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2782  ribosomal protein L7/L12  67.72 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0168829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  67.72 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  66.14 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  69.29 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
123 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
121 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 
128 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
125 aa  114  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 
128 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  66.93 
 
 
125 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  67.72 
 
 
124 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  65.08 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2073  ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  64.52 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
122 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  65.85 
 
 
122 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  65.85 
 
 
122 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
123 aa  110  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
127 aa  110  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  64.57 
 
 
123 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  68.5 
 
 
124 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>