More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4017 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 127 aa  241  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  48 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  48 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  48 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 127 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 125 aa  105  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  61.98 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  48.82 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3035  50S ribosomal subunit protein L7/L12  60.48 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  51.64 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  48.82 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  50.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2968  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3315  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.801397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  49.19 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 125 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4558  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.347891  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4394  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000226611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4481  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102709 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4484  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110879 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  49.19 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4362  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.993642  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  55 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  50.81 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  49.19 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0196  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000850088  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  51.94 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  48.39 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>