More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2723 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  100 
 
 
129 aa  234  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  88.37 
 
 
127 aa  161  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  75.97 
 
 
129 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
125 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  76.03 
 
 
125 aa  136  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 
126 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  69.75 
 
 
128 aa  130  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
120 aa  124  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  69.6 
 
 
124 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  65.29 
 
 
125 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 
128 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
126 aa  121  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  69.05 
 
 
128 aa  121  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  66.39 
 
 
122 aa  120  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  68.6 
 
 
123 aa  120  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  68 
 
 
124 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  61.16 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
119 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  69.6 
 
 
126 aa  116  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 
121 aa  116  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 
121 aa  116  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 
122 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  62.81 
 
 
124 aa  113  7.999999999999999e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 
121 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
124 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  64.46 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  72.65 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  111  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1473  50S ribosomal protein L7/L12  59.23 
 
 
132 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000879556  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  56.3 
 
 
123 aa  111  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4317  50S ribosomal protein L7/L12  59.29 
 
 
140 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
124 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 
127 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
125 aa  110  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  70.25 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3329  50S ribosomal protein L7/L12  59.29 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.979565  normal  0.213901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  62.81 
 
 
128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  64.46 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
128 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
125 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
128 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 
125 aa  107  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
125 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 
127 aa  107  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
125 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
127 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
123 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  49.18 
 
 
121 aa  107  8.000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 
127 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
126 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 
122 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  50.82 
 
 
122 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 
126 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
123 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  49.18 
 
 
121 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  50.82 
 
 
122 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
125 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
125 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
127 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 
124 aa  105  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  69.23 
 
 
126 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 
124 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
125 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
126 aa  104  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
124 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
124 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
124 aa  103  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
126 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3035  50S ribosomal subunit protein L7/L12  61.98 
 
 
124 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
126 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 
126 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
126 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  60.53 
 
 
125 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  60.87 
 
 
126 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
125 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 
122 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0141  ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
130 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 
122 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 
124 aa  102  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  58.97 
 
 
124 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>