More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1926 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
128 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  78.12 
 
 
126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  77.34 
 
 
124 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  79.69 
 
 
126 aa  153  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  77.34 
 
 
124 aa  149  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  80.49 
 
 
128 aa  146  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  71.77 
 
 
123 aa  145  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  71.88 
 
 
126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  71.88 
 
 
125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
129 aa  135  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 
127 aa  135  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  74.22 
 
 
125 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  76.19 
 
 
129 aa  133  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
128 aa  133  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  70.73 
 
 
125 aa  130  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  67.48 
 
 
122 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  70.73 
 
 
122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
125 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
121 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  65.85 
 
 
124 aa  125  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
126 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
129 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
119 aa  123  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  61.54 
 
 
126 aa  123  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  70.73 
 
 
123 aa  123  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  69.84 
 
 
129 aa  123  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
128 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
128 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
121 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  69.92 
 
 
128 aa  121  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
123 aa  120  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 
123 aa  120  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
123 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  70.97 
 
 
127 aa  120  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
124 aa  120  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 
127 aa  120  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
119 aa  120  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  70.31 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  70.31 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  66.14 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  65.04 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1473  50S ribosomal protein L7/L12  65.15 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000879556  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 
126 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  62.79 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  68.55 
 
 
126 aa  117  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
126 aa  117  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
125 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
120 aa  117  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
124 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  68.55 
 
 
127 aa  116  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
122 aa  116  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
123 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
122 aa  115  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 
125 aa  115  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
125 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 
126 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
123 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 
125 aa  114  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
126 aa  114  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
125 aa  114  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
123 aa  114  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 
124 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 
123 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
124 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 
124 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  61.07 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  64.23 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>