More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1548 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 127 aa  241  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  68.99 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 		 125 aa  133  9e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  66.14 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  62.99 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  63.78 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  63.78 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  62.7 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 127 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1457  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000553031  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  62.99 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  46.4 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  61.29 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  60.77 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 		 127 aa  107  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 123 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4317  50S ribosomal protein L7/L12  55.07 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3329  50S ribosomal protein L7/L12  52.78 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.979565  normal  0.213901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  59.83 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  61.16 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2782  ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  45.6 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2073  ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4064  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112087  hitchhiker  0.00864262 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  51.97 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0192  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000934048  hitchhiker  0.00053412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>