More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2107 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
122 aa  223  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  99.18 
 
 
122 aa  223  9e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0748  50S ribosomal protein L7/L12  81.97 
 
 
122 aa  159  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0407206  normal  0.893825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04531  50S ribosomal protein L7/L12  77.87 
 
 
122 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196154  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  70.73 
 
 
121 aa  140  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
122 aa  127  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
122 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
121 aa  120  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
122 aa  114  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 
121 aa  114  5e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  52.27 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 
125 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3917  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
121 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
121 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
121 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
121 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
121 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
121 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  60.98 
 
 
121 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
121 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
121 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
121 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 
128 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
121 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
121 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
121 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
121 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2675  ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
126 aa  107  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000113086  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
121 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
121 aa  107  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
126 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
126 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
121 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0639  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
122 aa  107  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.500427  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0186  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
123 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00287299  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0191  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
123 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000969343  hitchhiker  0.000734412 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
124 aa  106  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4064  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
121 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112087  hitchhiker  0.00864262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0192  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
121 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000934048  hitchhiker  0.00053412 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4474  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
121 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 
122 aa  105  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0191  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
123 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000396495  hitchhiker  0.00119483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3732  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
122 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0188  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
121 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000136924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 
123 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4394  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
121 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000226611  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
123 aa  104  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4481  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
121 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102709 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
125 aa  104  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4362  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
121 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.993642  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4484  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
121 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4558  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
121 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.347891  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  63.56 
 
 
124 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002172  LSU ribosomal protein L7/L12 (L23e)  58.54 
 
 
122 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
123 aa  103  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 
123 aa  103  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 
121 aa  103  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 
127 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00226  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
122 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4770  ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 
119 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0196  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 
121 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000850088  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0162  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
122 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000100689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
126 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 
126 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  100  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
124 aa  100  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
125 aa  100  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  51.69 
 
 
124 aa  100  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  60.17 
 
 
126 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  100  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
125 aa  100  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
128 aa  100  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0276  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00026  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 
126 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1175  50S ribosomal protein L7/L12  57.66 
 
 
126 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000154127  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4698  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
122 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163845  hitchhiker  0.00000529046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  53.12 
 
 
128 aa  99.4  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
125 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
127 aa  98.6  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2867  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 
121 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346272  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 
122 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 
122 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  52.5 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 
124 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4325  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000520258  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 
126 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>