More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3329 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3329  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 140 aa  259  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.979565  normal  0.213901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4317  50S ribosomal protein L7/L12  96.43 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1473  50S ribosomal protein L7/L12  70.8 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  59.57 
 
 		 128 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  57.86 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  61.36 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  52.52 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  53.03 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  53.03 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  57.86 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  60.58 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  59.09 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  61.94 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  59.09 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  54.68 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  57.86 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  53.33 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  55.97 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  51.43 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  58.21 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  51.43 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  59.29 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  59.29 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  57.58 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  54.01 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  50.76 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  54.01 
 
 		 123 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  56.72 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  56.06 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  56.72 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  56.82 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  51.82 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  57.86 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  54.01 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  53.03 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  56.06 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  53.62 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  54.01 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  52.55 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  50.36 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  56.06 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  52.99 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  51.82 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  55 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  56.2 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  55 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  51.49 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  55 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  77.78 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  52.27 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  77.78 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  52.99 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  50.75 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  76.39 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  58.39 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  55.07 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  49.25 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  44.03 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  55.07 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  56.82 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  55 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  52.24 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  50.75 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  60 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  52.99 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  56.06 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  47.76 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  77.78 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  54.01 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  54.48 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  53.79 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  53.57 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  53.57 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  53.57 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  56.06 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  53.57 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  56.82 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  53.57 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  53.57 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  53.57 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  49.29 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  49.29 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>