More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1317 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
124 aa  228  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  93.6 
 
 
125 aa  197  5e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  89.6 
 
 
125 aa  191  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  88.8 
 
 
125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  80.65 
 
 
124 aa  170  5e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  78.23 
 
 
122 aa  164  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  82.4 
 
 
125 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  81.6 
 
 
125 aa  160  6e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1457  50S ribosomal protein L7/L12  81.6 
 
 
125 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000553031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  74.19 
 
 
124 aa  157  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
128 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
122 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 
128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 
125 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  131  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  69.35 
 
 
127 aa  130  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
124 aa  130  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
127 aa  124  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
121 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 
126 aa  123  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 
126 aa  123  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 
125 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
127 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 
128 aa  122  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  62.2 
 
 
127 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
121 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
121 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 
123 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
121 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0413  50S ribosomal protein L12P  63.71 
 
 
124 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
121 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
127 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 
126 aa  121  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
126 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
126 aa  120  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
121 aa  120  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  63.87 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
124 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  65.49 
 
 
123 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 
126 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 
124 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  65.55 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  67.52 
 
 
123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
122 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
129 aa  116  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
127 aa  116  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  62.71 
 
 
124 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  63.25 
 
 
123 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
125 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
125 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  66.39 
 
 
125 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  67.8 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3190  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
124 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 
123 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  65 
 
 
123 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 
126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 
125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  60.94 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0440  50S ribosomal protein L7/L12  67.72 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3917  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
123 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  62.81 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  60.5 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  66.95 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  61.34 
 
 
123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  61.16 
 
 
125 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
122 aa  111  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  65.25 
 
 
124 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
126 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 
126 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  58.87 
 
 
121 aa  110  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>