More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0463 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 128 aa  237  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 128 aa  237  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  75.4 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0356  50S ribosomal protein L7/L12  71.88 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  61.24 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  63.49 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  67.19 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1783  50S ribosomal protein L7/L12  67.44 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  67.97 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  73.81 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  67.19 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  66.13 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  58.46 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  65.87 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 129 aa  108  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1473  50S ribosomal protein L7/L12  60.61 
 
 		 132 aa  107  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  60.47 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  62.99 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2675  ribosomal protein L7/L12  66.96 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000113086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  67.72 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  64.06 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01080  ribosomal protein L7/L12  65.62 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  62.5 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  59.38 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  65.04 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  58.59 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  63.28 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3329  50S ribosomal protein L7/L12  52.82 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.979565  normal  0.213901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4317  50S ribosomal protein L7/L12  52.82 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>