More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2782 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2782  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
127 aa  236  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0168829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  77.17 
 
 
127 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  78.74 
 
 
127 aa  148  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  75.4 
 
 
128 aa  148  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 
128 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  63.71 
 
 
125 aa  134  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2073  ribosomal protein L7/L12  71.09 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0440  50S ribosomal protein L7/L12  76.8 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  71.65 
 
 
127 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  65.35 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  67.72 
 
 
127 aa  126  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  67.74 
 
 
124 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  69.29 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1457  50S ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000553031  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  62.9 
 
 
124 aa  122  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  65.32 
 
 
126 aa  120  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  70.08 
 
 
126 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 
128 aa  116  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  66.94 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
121 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2177  ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.866659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 
125 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 
121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 
129 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
121 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
124 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  62.2 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
124 aa  106  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
122 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
126 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 
121 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 
126 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 
125 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
129 aa  104  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
126 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
126 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3917  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
123 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
122 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  58.73 
 
 
128 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
119 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
128 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  49.6 
 
 
122 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  49.6 
 
 
122 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
126 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
128 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
129 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 
125 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
125 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 
125 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
122 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 
126 aa  100  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 
124 aa  100  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
121 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
121 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
127 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
123 aa  99.4  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 
133 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1508  ribosomal protein L7/L12  60.63 
 
 
127 aa  99  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000145958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  48.03 
 
 
127 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 
128 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1042  ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
124 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
122 aa  98.2  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  57.8 
 
 
131 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  54.03 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>