More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1017 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 131 aa  246  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  75 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  78.03 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  78.03 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  77.1 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  75.57 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  69.47 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  71.43 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  61.07 
 
 		 179 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  64.89 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  64.89 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  63.36 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  64.12 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2153  50S ribosomal protein L7/L12  64.12 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2468  50S ribosomal protein L7/L12  64.89 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  60.31 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  61.36 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  58.78 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37027  predicted protein  55.38 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00417433  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  58.78 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  53.44 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  53.44 
 
 		 124 aa  106  8.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  48.12 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  57.25 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  48.12 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0141  ribosomal protein L7/L12  62.86 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 125 aa  103  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 		 121 aa  103  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  55.73 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  55.73 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  51.15 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  54.2 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  48.48 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  50.38 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  57.25 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  46.56 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  57.25 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  52.67 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  50.38 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  55.04 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0276  50S ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00026  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4558  50S ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.347891  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4362  50S ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.993642  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4484  50S ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0196  50S ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000850088  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1457  50S ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000553031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>