More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27801 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  353  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  83.21 
 
 
131 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  82.44 
 
 
131 aa  158  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  78.63 
 
 
131 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  81.06 
 
 
132 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  80.15 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  80.15 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  77.86 
 
 
131 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2153  50S ribosomal protein L7/L12  79.39 
 
 
128 aa  150  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66919  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2468  50S ribosomal protein L7/L12  79.39 
 
 
129 aa  145  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  62.88 
 
 
129 aa  140  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  68.7 
 
 
128 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  64.12 
 
 
128 aa  124  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  58.65 
 
 
133 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  57.58 
 
 
132 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  57.58 
 
 
132 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
131 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  61.07 
 
 
131 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
128 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 
122 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 
122 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
121 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 
121 aa  101  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
125 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  52.67 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 
126 aa  97.8  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  46.56 
 
 
121 aa  97.4  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  52.67 
 
 
124 aa  97.1  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
125 aa  96.3  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
127 aa  96.3  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 
125 aa  96.7  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 
122 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  54.2 
 
 
126 aa  95.5  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
125 aa  94.7  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 
124 aa  94.7  7e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 
129 aa  94.7  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  52.67 
 
 
129 aa  94  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  52.67 
 
 
124 aa  92.8  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3447  ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
121 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00096763  hitchhiker  0.00626302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
121 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  48.48 
 
 
124 aa  92.4  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
124 aa  92  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
123 aa  92  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  52.27 
 
 
126 aa  92  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 
123 aa  91.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
121 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  48.48 
 
 
122 aa  91.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
125 aa  91.3  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 
131 aa  91.3  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 
127 aa  90.9  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
123 aa  90.9  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  46.83 
 
 
128 aa  90.9  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
126 aa  90.9  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
127 aa  90.5  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  49.23 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
121 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
121 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  51.49 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
121 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  45.8 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  45.8 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  48.41 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
121 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
121 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 
124 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  41.98 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
121 aa  89.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
121 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  45.08 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  47.33 
 
 
121 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4325  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000520258  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
121 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 
121 aa  89.4  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0597  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
123 aa  89  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0210666  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  46.88 
 
 
126 aa  88.6  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00694  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
125 aa  88.6  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  48.82 
 
 
129 aa  88.2  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 
125 aa  88.2  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0276  50S ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 
121 aa  87.8  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00026  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 
122 aa  87.8  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37027  predicted protein  51.54 
 
 
149 aa  87.8  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00417433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 
122 aa  87.8  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  45.04 
 
 
120 aa  87.4  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
126 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  50.76 
 
 
124 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 
123 aa  87  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 
126 aa  87  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4698  50S ribosomal protein L7/L12  45.8 
 
 
122 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163845  hitchhiker  0.00000529046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  49.24 
 
 
128 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  50.76 
 
 
124 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4064  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
121 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112087  hitchhiker  0.00864262 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  57.25 
 
 
125 aa  87  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0150  ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 
122 aa  87  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000840717  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
125 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  57.25 
 
 
125 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 
128 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 
128 aa  86.3  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  47.66 
 
 
126 aa  86.3  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  48.39 
 
 
124 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  50.75 
 
 
122 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>