More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0392 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
124 aa  233  8e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
121 aa  120  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
123 aa  114  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
125 aa  114  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  51.59 
 
 
126 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  60.17 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  60.55 
 
 
125 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 
126 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0597  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 
123 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0210666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00694  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  56.45 
 
 
124 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  65.14 
 
 
125 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 
131 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  54.96 
 
 
131 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4698  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
122 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163845  hitchhiker  0.00000529046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
128 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 
125 aa  104  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
122 aa  104  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3817  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2642  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3787  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 
127 aa  103  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3468  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3755  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.062938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3179  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000124958  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1913  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
124 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000803393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
123 aa  103  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
125 aa  103  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 
128 aa  103  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  54.2 
 
 
179 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0162  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
122 aa  103  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000100689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
124 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0150  ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 
122 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000840717  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  55.12 
 
 
127 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4064  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112087  hitchhiker  0.00864262 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  53.23 
 
 
121 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0192  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000934048  hitchhiker  0.00053412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0188  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000136924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
129 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0587  50S ribosomal protein L7/L12  60.8 
 
 
125 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4474  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
121 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3447  ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00096763  hitchhiker  0.00626302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 
125 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4325  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 
122 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000520258  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  52.34 
 
 
128 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  57.98 
 
 
125 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
125 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0191  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
123 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000396495  hitchhiker  0.00119483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 
130 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 
123 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  60.75 
 
 
123 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  62.28 
 
 
132 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
124 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 
121 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 
122 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0413  50S ribosomal protein L12P  53.23 
 
 
124 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291542  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 
122 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 
126 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  56.3 
 
 
123 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 
129 aa  100  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4394  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000226611  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4362  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.993642  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  51.61 
 
 
122 aa  100  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4481  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
121 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>