More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0318 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 126 aa  229  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  88.89 
 
 		 126 aa  185  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  77.42 
 
 		 125 aa  179  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  75.81 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  80.65 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  77.42 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  74.19 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  55.83 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2995  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  67.24 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  65 
 
 		 127 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  55.83 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  55.83 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  48.36 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  58.87 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  62.93 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  56.59 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  58.54 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  49.21 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  53.28 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  55 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3035  50S ribosomal subunit protein L7/L12  60.83 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3190  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 129 aa  100  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  55.83 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01080  ribosomal protein L7/L12  62.24 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  62.93 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>