More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4010 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
131 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  75.57 
 
 
129 aa  177  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  75.57 
 
 
131 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  75.57 
 
 
128 aa  152  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  73.48 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  73.48 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  69.47 
 
 
128 aa  140  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  67.67 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  62.6 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  61.83 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2468  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  61.83 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  62.6 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  60.31 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 
125 aa  115  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  64.39 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  57.25 
 
 
125 aa  110  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  57.25 
 
 
125 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2153  50S ribosomal protein L7/L12  65.65 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37027  predicted protein  58.46 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00417433  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 
127 aa  106  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  53.44 
 
 
130 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
128 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
128 aa  104  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 
124 aa  104  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
125 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
122 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
122 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 
125 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  51.15 
 
 
121 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  57.25 
 
 
126 aa  102  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  51.64 
 
 
123 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  57.25 
 
 
124 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 
125 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  48.09 
 
 
121 aa  102  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  56.49 
 
 
125 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
124 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  57.48 
 
 
124 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
124 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 
123 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1457  50S ribosomal protein L7/L12  55.73 
 
 
125 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000553031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  51.91 
 
 
124 aa  100  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
122 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 
125 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 
129 aa  100  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  54.2 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  46.56 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  50.38 
 
 
122 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0141  ribosomal protein L7/L12  59.05 
 
 
130 aa  98.6  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  56.59 
 
 
131 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 
129 aa  98.6  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  58.02 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 
126 aa  97.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
122 aa  97.1  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  51.16 
 
 
126 aa  97.1  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  53.44 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 
131 aa  96.7  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
126 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  56.25 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  53.44 
 
 
128 aa  95.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  53.44 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 
122 aa  94.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  52.67 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  47.33 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 
126 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  53.44 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
126 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  45.04 
 
 
121 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 
127 aa  93.6  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  56 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  54.03 
 
 
125 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  48.85 
 
 
128 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  52.67 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  52.67 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  51.16 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>