More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0141 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0141  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 130 aa  230  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000137208  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 129 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  68.03 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  68.03 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  64.75 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  59.29 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  60.31 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  62.7 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  61.9 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  57.52 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  56.82 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  52.63 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  55.73 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  61.9 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  65.25 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4317  50S ribosomal protein L7/L12  57.04 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 		 125 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  55.74 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  65.57 
 
 		 125 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  55.73 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1473  50S ribosomal protein L7/L12  59.09 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  63.56 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  61.54 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3329  50S ribosomal protein L7/L12  56.34 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.979565  normal  0.213901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  52 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03680  LSU ribosomal protein L12P  53.03 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.770904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  59.84 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  52.46 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  64.35 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  53.44 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>