More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2555 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 128 aa  234  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  82.95 
 
 		 129 aa  191  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  69.7 
 
 		 132 aa  149  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  69.7 
 
 		 132 aa  149  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  77.34 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  73.28 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  65.41 
 
 		 133 aa  141  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  70.23 
 
 		 131 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  64.12 
 
 		 179 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  63.41 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  67.18 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2153  50S ribosomal protein L7/L12  72.66 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66919  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  67.94 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  67.94 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  67.94 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2468  50S ribosomal protein L7/L12  69.77 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  67.18 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  67.18 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  61.6 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  60.98 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  57.81 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0141  ribosomal protein L7/L12  65.69 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  65.15 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  51.94 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  57.81 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  58.27 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37027  predicted protein  51.97 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00417433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  48.44 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  59.06 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  62.3 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  59.02 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  52.85 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 127 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3156  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 128 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  48.44 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  50.79 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>