More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2343 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
125 aa  236  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  70.63 
 
 
126 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  78.4 
 
 
124 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  75.4 
 
 
126 aa  141  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  63.11 
 
 
128 aa  140  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  73.44 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  70 
 
 
123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  69.05 
 
 
126 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  70.4 
 
 
124 aa  130  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  66.39 
 
 
128 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  70.63 
 
 
125 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  57.36 
 
 
129 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
121 aa  120  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  64.8 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  60.66 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  61.48 
 
 
125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  62.6 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0184  LSU ribosomal protein L12P  67.46 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000278769  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  61.67 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  52.89 
 
 
121 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  66.4 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 
124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  62.4 
 
 
119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
125 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  60.33 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  64 
 
 
129 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  63.2 
 
 
119 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  62.81 
 
 
124 aa  111  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  49.59 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 
126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  61.16 
 
 
127 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  65 
 
 
127 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  64.46 
 
 
123 aa  110  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0489  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 
128 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.223165  hitchhiker  0.00000150598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0318  50S ribosomal protein L7/L12  57.38 
 
 
128 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.038459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  62.81 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  68.29 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  54.1 
 
 
124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
122 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
122 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 
128 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  58.68 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  58.2 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
126 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
126 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 
123 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  63.33 
 
 
127 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 
123 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 
130 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0916  ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 
127 aa  106  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599285  normal  0.231708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1326  ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 
126 aa  106  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 
123 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
124 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
125 aa  105  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  57.02 
 
 
125 aa  106  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 
122 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 
123 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  59.5 
 
 
125 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 
124 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
122 aa  104  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  65 
 
 
126 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 
125 aa  104  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
123 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  61.16 
 
 
125 aa  104  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
124 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
126 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 
128 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 
127 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
120 aa  104  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  52.03 
 
 
125 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 
124 aa  103  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  57.6 
 
 
125 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
121 aa  103  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
121 aa  103  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 
125 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
126 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  54.55 
 
 
124 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  59.68 
 
 
130 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  53.6 
 
 
122 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 
125 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 
123 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  61.98 
 
 
126 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  52.38 
 
 
126 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  56.2 
 
 
125 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 
126 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0413  50S ribosomal protein L12P  55.37 
 
 
124 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291542  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  44.63 
 
 
121 aa  102  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  57.85 
 
 
126 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  50.44 
 
 
123 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
126 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>