More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0442 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 130 aa  249  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  50.76 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  48.46 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  53.39 
 
 		 121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  50.88 
 
 		 122 aa  105  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  50.88 
 
 		 122 aa  105  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  53.08 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  54.62 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  46.28 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  52.89 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  69.01 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  53.08 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  53.66 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  72.22 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  55.37 
 
 		 127 aa  100  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  51.54 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  51.67 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  53.08 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  52.42 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  51.54 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0746  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00478946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00694  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  70.83 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  66.67 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  51.54 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4064  50S ribosomal protein L7/L12  64.47 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112087  hitchhiker  0.00864262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  51.33 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  65.28 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  65.28 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  54.62 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  46.92 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  53.08 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  52.89 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  50.77 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  51.67 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  71.83 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2543  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0150  ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000840717  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0188  50S ribosomal protein L7/L12  64.47 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000136924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  52.21 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0192  50S ribosomal protein L7/L12  64.47 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000934048  hitchhiker  0.00053412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  53.08 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4474  50S ribosomal protein L7/L12  64.47 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  65.28 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  50.83 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  53.08 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  54.87 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3450  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0256667  normal  0.0368357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  65.28 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  48.67 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0162  50S ribosomal protein L7/L12  63.89 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000100689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  51.33 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  70.42 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1060  50S ribosomal protein L7/L12  66.2 
 
 		 126 aa  94  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  70 
 
 		 123 aa  94  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  50.83 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0191  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000396495  hitchhiker  0.00119483 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  69.01 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  49.62 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  50.44 
 
 		 124 aa  93.2  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  48.46 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  68.06 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>